先来一个绣花枕头(并非贬义)版本,当置信上下界(下图中为95%)同正同负时,勾勒一个圆环,外圈所围面积为置信上界,内圈所围面积为置信下界。当置信上界和下界符号不同时,画两个圆,先画绝对值较大的,再画绝对值较小的,并用不同颜色以示区分-,这样以来,上下界皆可看清,并且跨越0的置信区间对应的图就不是圆环了。图中的红叉表示不显著的系数(a=0.05)

上图看来新奇,但展示置信区间还是用长度直观明了,下图为不同置信水平下置信区间的动画演示。每个矩形上下边的黑线分别为上下置信界,中间的黑线(并不是上下界的均值!)为相关系数大小,水平的点划线为0基准线。随着置信水平(1-a)的增大,置信区间长度不断增大。

该gif动画较大,440k左右,网速慢的可能得稍候几秒,pdf版本见此

更多例图,参见我的Google Docs,共56张图形,恰合我华夏名族之数目(美其名曰corrplot华夏图?)。国内google docs 在线查看速度可能比较慢,下载后用pdf浏览器全屏观看效果为佳。

上面的所有图片代码都在corrplot-0.3版本之中,目前还没有在CRAN上,Rforge估计还得一两天。(注:现在已在了)

近来生成swf、gif等动画都是animation之功劳,很是方便,感谢YH:)

———————————–分割之—————————————
corrplot 0.3版本变动如下:

1. 发现原来代码有些地方还是累赘,还有小bug,精简并kill 了一下bug,目前没有一个for循环(这种仇视for的心态或许并不好)。
2. 原来变量名起得不好,这次大动了手术,争取见名知意,且能迅速记住,并不发生混淆。
3. 进一步做好细节工作,主要是文本标签和颜色标签,提供了更灵活的布局方式,从上面提到的corrplot华夏图中即可见端倪,比如颜色棒可选择在右或下,并可以自由控制宽度。

目前的corrplot包一个优点是很灵活,可以自由控制很多东西;但同时,这个优点也是成了它最大的缺点,那么多参数,看得人眼花。

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  10 Responses to “相关矩阵中置信区间之涂鸦”

  1. 不错不错,支持一下。 :)

  2. 8) 占个板凳,慢慢看~

  3. 今天在cran上看到corrplot更新了,支持一下,顺便问问,Mac下的0.3何时更新? 谢谢 :)

    • 兄台用Mac啊,主站上包是按顺序编译的,先放源码、再win、再MAC,我想应该在24小时之内出炉吧。

      谢谢您的关注,corrplot以后会更多的关注模型、算法 :-|

      • 今天更新到3.0,多谢。

        我很少用R,算是新手,惭愧,还望多多指教。主要是想读读代码,把基本功能移植到matplotlib上。

  4. 哎呀,好漂亮的图图哦,可视化被你玩活了。
    我最近想弄一个贺卡,太云兄有何好的建议么?
    问题网址http://cos.name/cn/topic/103272,借贵
    宝地想广大有奇思异想的童鞋们讨个好方案。

  5. 很不错, 考虑用一下!

  6. 终于尝试了你的这个包,功能非常强大!
    Google Docs中的例图尤其吸引人!我最终选择了与图19非常类似的一种图。
    两个小建议:
    1)不知道是约定俗成还是什么别的原因,在生物学领域的论文中这种相关图均采用暖色表示正相关,而冷色表示负相关。比如你的红蓝颜色,红色表示正相关,蓝色表示负相关。这虽然不会影响结果,但是当我看到蓝色表示正相关(该函数的缺省设置!)的时候总有些不太适应。不知道是否可以更新一下缺省设置。

    2)如你提到的一般,这个函数参数众多,一时确实不易全部掌握。而你的googledocs中的例子起到了非常好的向导作用。如果能够在选中自己喜好的图之后,马上就可以在图的附近看到相关参数的设定,那么生活就会更加美好了! :-)

    总而言之,多谢你给我们提供了一个好的工具!

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