更新了一下corrplot包，变动如下：
1. 解决了之前的一些小bug，并且把原来的一些for()循环用*apply函数重写了一下。
2. 增加了corr.rect()函数，可以在相关阵的图上面框框，类似于谱系图上面的那种矩形，即将原来的多个变量分为n类。这两种图（见图1、图2）可以好好比较一下，各有特点。
3. 在原先的corrpot()函数中，当排序方式为系统聚类时，可以根据聚类结果直接加框框，具体由rect.hc, rect.col, rect.lwd三个参数控制。当然，也可以在图画完之后，用corr.rect()函数再加，只不过方便性上打了折扣。
目前，CRAN主页上新版已经出炉，国内中科院的两个镜像还没有同步，大约得半天左右吧(香港那个镜像早已废弃)。此外，WINDOWS下默认的图形设备在绘制png等非矢量格式图时，效果欠佳，建议用Cairo包或者cairoDevice包来生成质量较高的png图片。
图 1 corrplot画出来的
图1代码如下：
corrplot(cor(mtcars), order="hclust", rect.hc = 3)
图2 传统的聚类谱系图，可以与图1好好比较一番
再放一个图1和图2的联姻图：
图3 二者之联姻，和heatmap有些相似
corrplot包的其他问题：
1. DESCRIPTION文件里面的suggests package里面不小心加了个rgl包，悲剧悲剧。
2. corrplot()函数参数过多，现在是38个左右，很多时候我自己都要返回去看看参数意义，显得比较累赘。
3. 变量的文本标签的计算方法不太好，有时得多次调解cex参数，比较麻烦，这个是个比较大的问题。
4. 之前，准备多做做变量排序的事情，后来发现seriation包已经做得非常好了，其中一位作者Kurt还是R core之一，每次提交package时，几乎都是他把关。corrplot包的定位还是轻量级，在维数<50的时候娱乐娱乐。
欢迎广大朋友批评指正。
原来太云的头像就是第一个图啊。这个图很形像哈，关联程度越深，点就越大，颜色也越深，的确对图片的质量要求较高。呵呵，可不可以把坐标轴的标签全部水平放置，竖着看起来有点累。
不算是第一个图，我的是PCA排序的，并且没有分成小块块。
本问题中横着可以，因为单词长度问题，竖着经常会重叠~
去RUC了，向兄台请教VIM:)
呵呵，不敢当，叫我晓伟就行了，互相学习，共同进步，咱得有开源精神@传说中不是七月有R会议吗？到北京参加吗？
要的，希望能聆听王兄的演讲啊:)
呵呵，我是当听众去学习的，演讲的水平还达不到。到时候就能提前见面了@
额，网卡了，回复了两遍，单词长的话，可以考虑相对坐标轴倾斜45度。
大胆演讲嘛，大家都是初学者，谈什么都行的。我们要有开源精神嘛，哈哈
太云，你这个框框很有意思
又加了个图3，把前两个整合在一起了
呵呵，娱乐、消遣而已~
呵呵，还一直没用过。今天拿来用了一下。好话就不说了，提点意见。
其实图的本质跟R内置的heatmap很像，但做得更漂亮，更灵活。但缺点也有，因为局限于相关系数，所以显示范围只有-1~1，而如果我想可视化若干个集合间重叠，首先是需要自己做normalization，然后是corrplot产生的那个legend也只能是这个范围，或者用cl.range调整成更小的范围，没法表达两个集合间重叠元素的数量。不知道是不是我看文档不仔细。
建议是不要局限于相关矩阵，可以放宽到任何类型的矩阵的可视化：）
把非-1~1的元素调整到-1到1之间的装换方法很多，这一步我觉得应该留给使用者本人。只要放宽legend的范围，这样也就放宽到任何类型的矩阵可视化了吧。
此外，cl.range的意思你的理解有误，只是两种颜色坐标的绘图方式而已。
如何放宽legend的范围？
比如，8~54
这个还没弄的，目前还不支持的:(
呵呵，嗯，个人觉得这个很实用。
Rforge上已经加了~
现在是0.3版了，第一个图的那个参数rect.hc是改成addrect了吧
准备用你这包来画图
Thanks!